Geber86 / Getty Images
Pengambilan Utama
- Children’s Hospital Los Angeles melakukan tinjauan COVID-19 genom pediatrik terbesar setakat ini.
- Kajian ini melaporkan kemungkinan hubungan antara mutasi SARS-CoV-2 tertentu dan keparahan penyakit.
- Sampel menunjukkan tahap variasi genetik yang tinggi di California.
Seperti banyak virus, SARS-CoV-2, virus yang menyebabkan COVID-19, mengalami banyak mutasi genetik kerana menyebar ke seluruh populasi yang besar. Para saintis baru mula memahami variasi ini dan kesannya terhadap hasil kesihatan, terutama pada kanak-kanak.
Dalam kajian COVID-19 genom pediatrik terbesar setakat ini, satu pasukan dari Children’s Hospital di Los Angeles menemui kaitan antara mutasi virus dan keparahan penyakit. Kajian November diterbitkan dalam jurnalBuka Forum Penyakit Berjangkit.
"Sekiranya kita dapat melakukan apa saja untuk mengetahui apakah ada hubungan antara genetik mutasi genom virus dengan fenotip penyakit (ciri-ciri COVID-19 yang dapat dilihat), anda dapat diberitahu tentang cara terbaik untuk merawat pesakit," Xiaowu Gai , PhD, salah seorang penulis kajian dan pengarah bioinformatik di Hospital Kanak-kanak Los Angeles, memberitahu Verywell.
Dalam usaha untuk lebih memahami bagaimana variasi genetik dapat mempengaruhi populasi pediatrik, pasukan penyelidik menganalisis maklumat genetik virus dari 141 kanak-kanak yang dijangkiti antara 13 Mac dan 16 Jun. Sampel ini menunjukkan tahap variasi yang tinggi dan kelaziman mutasi yang dikaitkan dengan kadar penghantaran yang lebih tinggi.
Apa Ini Bermakna Untuk Anda
Bahan genetik SARS-CoV-2, virus yang menyebabkan COVID-19, terus berkembang. Para saintis berusaha untuk memahami bagaimana mutasi genetik dapat mempengaruhi penularan virus dan keparahan penyakit bagi pesakit yang dijangkiti.
Virus yang sentiasa berubah
Mutasi adalah kesalahan yang berlaku dalam genom virus-atau bahan genetik-ketika ia meniru. Sebilangan besar virus mengalami beberapa variasi kerana menyebarkan populasi. Di SARS-CoV-2, banyak mutasi tidak signifikan atau bahkan dapat melemahkan virus. Yang lain, bagaimanapun, boleh mempengaruhi seberapa mudah virus ini ditularkan dan seberapa parah penyakitnya.
"Apabila banyak orang memikirkan COVID-19, mereka memikirkan satu perkara ini, keunikan ini," kata Gai. "Tetapi itu bukan cara kita melihatnya. Virus di mana-mana pesakit dengan jangkitan virus adalah campuran dari banyak salinan virus ini. "
Satu mutasi umum, yang disebut D614G, menyebabkan perubahan pada protein lonjakan virus. Walaupun tidak lazim ketika virus mulai menyebar di seluruh dunia awal tahun ini, versi tersebut sejak itu menjadi dominan di seluruh dunia. Penulis melaporkan bahawa terdapat dalam 99.3% sampel pediatrik yang mereka kumpulkan.
Mutasi D614G, yang meningkatkan protein lonjakan yang digunakan oleh virus untuk masuk ke sel manusia, memungkinkan virus untuk menyebarkan dengan lebih mudah. Belum ada bukti yang pasti bahawa mutasi ini mengubah keparahan gejala penyakit.
Protein lonjakan COVID-19 memediasi kemasukan coronavirus ke dalam sel inang.
Walau bagaimanapun, pasukan penyelidik menemui hubungan antara clade 20C - versi virus yang bermutasi - dan gejala yang lebih teruk. Kelompok 20A, 20B, dan 20C semuanya versi virus yang baru dimutasi. Semua kes pediatrik yang teruk dan semua kecuali satu kes yang agak teruk dalam kajian ini membawa versi virus dengan klade 20C.
Implikasi Mutasi
"Ketika orang ramai melihat pernyataan seperti ini, terdengar menakutkan virus itu bermutasi," kata Stuart Campbell Ray, MD, pakar penyakit berjangkit dan profesor perubatan di Universiti Johns Hopkins, kepada Verywell. "Tetapi semua virus RNA memiliki tingkat mutasi. Dan kadar mutasi SARS-CoV-2 kira-kira lima kali ganda lebih perlahan daripada influenza — paling tidak sampai sekarang. ”
Kadar mutasi yang agak perlahan ini dapat membantu para saintis yang berusaha mengatasi virus novel ini. Walau bagaimanapun, Ray memberi amaran bahawa apabila populasi orang yang dijangkiti meningkat, begitu juga kelajuan mutasi yang berlaku.
Dengan pengenalan penyelesaian untuk menyokong sistem kekebalan tubuh terhadap infeksi virus - seperti vaksinasi, pendedahan sebelumnya kepada virus, plasma pemulihan, dan terapi antibodi - SARS-CoV-2 dapat berkembang untuk menghindari tindak balas imun. Ini bermakna ada kemungkinan calon vaksin yang kini menjanjikan menjadi kurang efektif dalam beberapa bulan mendatang kerana virus tersebut terus bermutasi.
"Ada risiko - kerana pandemi ini di luar kendali - bahawa mutasi ini dapat terkumpul dan yang tepat dapat terjadi yang dapat menghindari tindak balas imun," kata Ray, yang tidak berafiliasi dengan kajian ini.
Vaksin yang telah terbukti berkesan masih akan melindungi tubuh daripada virus. Tetapi, seperti yang berlaku dengan virus lain yang meluas seperti influenza, vaksin tambahan atau versi baru mungkin diperlukan untuk menutup segala jenis virus baru yang muncul di masa depan.
Berurusan dengan Pembolehubah Tidak Diketahui
Walaupun COVID-19 sering dilaporkan kurang berat bagi kanak-kanak daripada orang dewasa, satu dari tiga kanak-kanak yang dimasukkan ke hospital kerana penyakit ini dimasukkan ke ICU, menurut kajian itu. Gai mengatakan bahawa bagi pesakit yang mengalami penyakit, memahami komposisi genetik virus dapat memberikan beberapa wawasan utama untuk pengembangan rawatan.
Namun, penyusunan virus itu sendiri hanya dapat memberi tahu genetik mengenai bagaimana ia akan memberi kesan kepada orang yang dijangkiti. Mereka juga mesti mempertimbangkan demografi dan maklumat genetik orang yang dijangkiti.
Gai memberi amaran bahawa walaupun penemuan ini mungkin menunjukkan adanya korelasi antara mutasi tertentu dan hasilnya, banyak kajian yang lebih besar masih diperlukan untuk menunjukkan bahawa mutasi pasti menyebabkan penyakit yang lebih teruk. Walaupun merupakan kajian COVID-19 pediatrik genomik terbesar setakat ini, ia hanya merangkumi 141 kanak-kanak.
"Itu sebenarnya bukan ukuran sampel yang sangat besar," kata Gai. "Kami tidak mungkin melakukan analisis korelasi untuk setiap mutasi individu dengan fenotip penyakit."
Selain itu, kajian ini tidak memperhitungkan perbezaan umur, jantina, keadaan yang sudah ada, dan faktor penting lain. Penemuan yang berkaitan dengan viral load pesakit juga mungkin tertinggal berdasarkan ketika sampel dikumpulkan dari pesakit. Namun, kajian ini menyumbang kepada peningkatan pengetahuan tentang bagaimana variasi genetik dapat membentuk hasil kesihatan yang penting.
"Kami memerlukan laporan seperti ini untuk mengetahui bagaimana virus itu berkembang," kata Ray. "Urutan dari kajian seperti ini, ketika disatukan dengan urutan dari seluruh dunia, memiliki nilai utama dalam membantu kita memahami bagaimana virus ini berkembang dan adakah kita perlu menyesuaikan strategi kita untuk menguruskannya."